O CEFET de Varginha est� usando a bioinform�tica como aliada no combate ao novo coronav�rus. Para isso, o centro federal come�ou um projeto de inicia��o cient�fica j�nior que est� analisando o genoma (conjunto de todos os genes de uma esp�cie de ser vivo) e as muta��es do coronav�rus na China, It�lia e Estados Unidos. O professor do curso de inform�tica, Wedson Gomes da Silveira Junior, est� coordenando a pesquisa e conta com a ajuda do aluno Guilherme Carvalho Theodoro.
O objetivo da an�lise � identificar as diferen�as entre os genomas do coronav�rus nos tr�s pa�ses para, posteriormente, estudar qual tratamento pode ser mais espec�fico para cada muta��o. Al�m disso, outra an�lise pode ser feita para comparar estes resultados com genomas de outros v�rus j� existentes, e, assim, observar as similaridades e diferen�as entre eles.
Assim, quando genoma do v�rus estiver dispon�vel, poder� ser realizado um estudo comparativo com os outros pa�ses. “Outra contribui��o ser� no registro para um poss�vel surgimento de novo v�rus”, completa Wedson.
Segundo Gomes, os genomas dos tr�s pa�ses j� foram mapeados e est�o dispon�veis no genbank (Banco de dados gen�tico internacional). “N�s iremos analisar, por meio de an�lises computacionais de bioinform�tica, a diferen�a entre o coronav�rus de cada pa�s, identificando quais foram as muta��es e diferen�as gen�ticas. Depois, iremos comparar as regi�es com v�rus j� conhecidos” afirma o professor.
Em raz�o do isolamento social, os pesquisadores est�o em suas respectivas casas. “Estamos nos preparando e realizando a parte mais b�sica, por�m n�o temos acesso aos computadores da institui��o e aos artigos mais recentes em casa”, explica o professor. Al�m disso, Gomes afirma que eles podem tentar realizar as an�lises em computadores dom�sticos via teleconfer�ncia. “Dentro das limita��es dom�sticas estamos iniciando com que � poss�vel”, completa. A pesquisa est� planejada para ser desenvolvida durante o ano de 2020.
Como ser� a pesquisa
O professor afirma que o objeto geral do projeto s�o os genomas. O primeiro passo ser� uma pr�-an�lise para verificar a qualidade das amostras, no software FastaQC. Ap�s isso, o genoma ser� submetido ao software de bioinform�tica Blast, por meio do qual ser�o realizados os alinhamentos (que � a identifica��o de igualdades e diferen�as entre os genomas).Depois deste passo, as sequ�ncias ser�o colocadas no PRINSEQ para se ter gr�ficos que mostram, em n�meros, as similaridades das muta��es da COVID-19. Por fim, ser�o comparadas com sequ�ncias j� conhecidas de outras patologias e v�rus conhecidos a partir do Artemis Sanger.
"Dessa forma, eles ser�o comparados e as diferen�as entre eles ser�o analisadas. Em rela��o as muta��es, as sequ�ncias do genoma j� catalogadas em outros seres e demais patologias associadas”, explica o professor. Entretanto, o pesquisador lembra que esta explica��o est� simplificada pois "t�m outros detalhes t�cnicos mais espec�ficos da �rea". Al�m disso, Wedson afirma que as ferramentas uzadas durante a pesquisa s�o gratu�tas.
*Estagi�ria sob supervis�o de �lvaro Duarte